工业、运输仓储及通讯产业、商业是爱沙尼亚三大支柱产业，其2001年度对GDP的贡献率分别为17.9％、16.2％和14.6％。
　　
　　爱主要的工业部门有：食品加工，木材加工，机械设备制造，轻工业和能源工业等。食品工业是爱重要的传统工业，主要生产奶制品、鱼制品、肉制品、面粉制品、饮料等。木材加工以生产锯木和木制品为主。机械设备制造业主要生产金属制品、运输工具、机械设备、通讯设备和电脑等。轻工业以纺织品、服装和皮革加工为主。能源工业则主要是油页岩的加工和发电。2001年爱工业总产值为471亿克朗（约合27亿美元），比上一年增长7.45％。但与上年增速相比，低了近6个百分点。
　　
　　中转运输业在爱国民经济中占有重要地位，其产值在GDP中所占比重约为10－11％。其运输的主要货物是俄罗斯出口欧洲的原油。转口运输每年为爱带来大量外汇收入，在平衡爱经常项目收支中起到了重要作用。由于世界经济发展速度下降、物流量减少，爱2001年中转运输业增长有限。全年铁路共运送货物3846万吨，比上年下降2.6％。其中中转货物量为3010万吨，比00年增长4.8％。塔林港吞吐货物3230万吨（在波海沿岸国家的8大港口中排在第三），同比增16％。其中，中转货物增15％。港口营业额为8.9亿克朗，纯利4.34亿克朗。
　　
　　十年来，爱通信业从小到大，发展较快。现百人手机拥有率（46％）及上网人数（31％），在波罗的海三国中均居首位。目前，爱每年都要投入大量资金进一步改善其通讯状况，除大力发展固定电话和移动电话用户外，爱还非常重视国际数据网络的建设和开发，计划在不久的将来，在社会生活的各个领域中全面实现信息化和网络化，将爱沙尼亚建设成世界上第一个"Internet国"。届时，任何一个公民都可以通过"电子公民系统"进行纳税、购物和办理银行手续，以及享受各种远程服务，还可以了解所有私人和公共机构的各类信息；政府机关则可以通过"电子政府系统"在网上讨论和表决属非机密性质的各类问题并付诸实施。
　　

        2001年爱运输、仓储及通信产业产值为138.2亿克朗，比上年增6.8％。
　　
　　爱批发零售商业发展迅猛，2001年的营业额（124亿克朗）是1993年的3倍。2001年的批发零售额比2000年增6.5％。特别值得一提的是，旅游业在拉动爱商业和运输业的增长中起了重要作用。来自北欧（主要是芬兰）的大量游客乘坐交通工具、住店、餐饮、购物……，为爱提供了大量就业机会，带来了滚滚财源。2001年，来爱的外国游客总人数达323万人，是1993年的2倍，是爱全国总人口的2.4倍。其中，70％以上为芬兰人。